1983年，在永安市燕江中路东侧（今林业要素市场附近）新建一所永安十三中30周年校庆
初级中学——永安城关中学，任吴森林第一任校长。从改革开放以来，永安城关中学连续十年获得永安市中考成绩全市前三，其中1988-1995年，历届中考永安城关中学包揽了前三名，在三明地区乃至全省享有良好的声誉。1996年，永安城关中学设立高中部，成为永安第八所完全中学。1998年被确立为三明市重点中学，2001年被确立为福建省重点中学。直到2006年，永安高中进行教学整合，只剩下5所高级中学（包括三明外国语学校）。同年，永安城关中学改名为“永安市第十三中学”。2007年，顺利通过省教育厅的验收，成为永安第二所省一级达标校。
永安十三中初中部从建校以来，一直保持着永安中考前列。2000年，自从永安六中的建立，永安十三中的初中教学质量逐步下降，逐渐跌至全市第三名，但该校师生通过教学改革和培养，教学水平稳中有升。在永安形成了六中、三中、十三中、八中东南西北四方鼎立局面。2014年，十三中有3名同学考入厦门双十中学，2名考入厦门外国语学校，2名考入厦门英才学校，10名考入三明一中，6名考入三明二中，全市中考成绩前300名中有85名来自十三中的毕业生，前三十名占了8个席位
永安十三中自1996年设立高中部以来，一直摸索高中教学发展，虽然高中教学起步虽晚，但教育教学质量稳步提高，先后培养了2位高考总分状元，9位学科状元。2004年来在各类学科竞赛中有3人获全国一等奖，28人省级获奖。在中学生创新大赛中共有6人获全国奖，12人省级获奖。2003年郑玉婷同学获三明市高考文科总分第二名，在三明市文科总分前十名中，该校占了5名，文理本一上线数列三明市第五。在2005年高考中该校取得历史性的突破，本一上线数211人，其中应届209人，居三明市各中学第四。2007年，通过省教育厅的验收，成为福建省一级达标校。2013年，永安十三中高中部中考录取分数线为505分。2014年，永安十三中高中部中考录取分数线为503分。
学校坚持“育人为本、教学为主、深化改革、优化管理、五育并举、和谐发展、全面提高”的办学指导思想，办学特色鲜明，努力构筑校园文化特色教育，学校以文化节、科技节、体育节为主轴，让丰富多彩的校园文化活动始终贯穿全年。 丰富多彩的文艺活动：演讲比赛、诗歌朗诵比赛、讲故事比赛、歌诵比赛、书法比赛、绘画比赛、歌手赛等，为广大学生提供了展现自我的平台，同时也提高了学生的艺术综合素质；每年5月份举办科技节，通过开设科技讲座、电脑作品竞赛、知识竞赛、小发明、小制作比赛，让学生在活动中去学科学、爱科学；每年11月份举办体育节，通过开展篮球赛、排球赛、趣味运动比赛、田径运动会，把学校的全民健身运动推向高潮。德育工作有声有色，德育成效显著，学校各项工作屡上新台阶，制定并实施了《五年发展规划》，全面贯彻教育方针，深化实施素质教育，大力推进高中新课程改革，加快校园建设，努力办成一所省级示范性高中。
永安十三中所在地/div>
永安十三中位于永安市南山路666号，也称永安十三中南山校区。坐落于南山脚下。漫步校园，风景如画。绿树掩映中，一幢幢现代化建筑巍然耸立：翰墨飘香的教学大楼，功能齐全的实验室，藏书新颖的图书馆，科学现代的塑胶田径运动场，条件优越的学生公寓，窗明几净的环保食堂，多种功能的阶梯教室。各类永安十三中南山校区
器材和教学设备均按一级达标校标准配备，拥有完善的现代先进的教学和生活设施。在这里，优雅怡人的校园环境与浓郁的时代气息融为一体，现代教育理念中厚重人文底蕴与高品位校园的紧密结合得到了完美的诠释。截止2009年底，建校投资已达8700万元。学校建立健全了安全工作管理机制，在安全防范方面投入了近二十万元，建立了以人防、物防和技防三位一体的安全管理平台，积极营造安全和谐的教育教学环境。
永安十三中奥体校区位于永安市含笑大道1399号，毗邻永安市奥林匹克体育中永安十三中奥体校区
心，是原城关中学的新校区，后因三明外国语学校的并入，由于三明外国语学校的校址过大，经教育局批准，将主校区移至南山校区。该校区拥有400米的省一级校园田径运动场和一幢教学楼和校区游泳馆。
《梦想起航》
填词：李雪妮 谱曲：杨雪梅
梦想起航那一秒
泛起我们久违的心跳
这个骄傲时刻脸上微笑绽放要让全世界知道
一路有你的记号
是彼此最坚强的依靠
毫无保留互挺到最后一秒
骄傲的青春共同打造
唱 唱 唱 是我们的讯号
就是追逐永不放慢步调
筑梦的城堡
努力就会闪耀
我要让全世界看到
梦想起航
就算是风浪滔天
也要大声的唱
不怕前方有再多险阻
筑梦让中国更强
放手翱翔
张开翅膀在此刻
梦已无可抵挡
坚定着希望勇往直前
梦在未来绽放
梦想起航
就算是风浪滔天
也要大声的唱
不怕前方有再多险阻
筑梦让中国更强
放手翱翔
张开翅膀在此刻
梦已无可抵挡
坚定着希望勇往直前
梦在未来绽放 梦想起航